Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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