Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms