Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dsg1bQ7TSF1 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dsg1bQ7TSF1 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms