Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 284.1 ms