Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ctdnep1Q3TP92 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms