Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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