Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms