Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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