Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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