Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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Sh3bp1P55194 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms