Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd9P28357 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd9P28357 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd9P28357 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd9P28357 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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