Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm16121-201ENSMUST00000128520 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm26628-201ENSMUST00000181028 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms