Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P20040 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P20040 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P20040 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P20040 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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