Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Kctd21-201ENSMUST00000054107 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Btnl10-203ENSMUST00000108818 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Btnl10-201ENSMUST00000020792 1028 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms