Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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H2-Q1O19441 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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H2-Q1O19441 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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H2-Q1O19441 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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H2-Q1O19441 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
H2-Q1O19441 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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H2-Q1O19441 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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