Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms