Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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