Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
NcanP55066 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NcanP55066 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms