Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxc13P50207 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxc13P50207 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxc13P50207 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxc13P50207 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxc13P50207 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxc13P50207 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxc13P50207 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Hoxc13P50207 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms