Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprkP35822 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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