Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Eps15l1-205ENSMUST00000212590 3376 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prim1P20664 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms