Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ccnb1ip1-201ENSMUST00000095932 1509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Triml2-204ENSMUST00000210136 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Fam221b-201ENSMUST00000056474 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Mfsd8-201ENSMUST00000026859 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Sox5-204ENSMUST00000111748 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gramd1b-203ENSMUST00000119373 3857 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm16239-201ENSMUST00000160182 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Rhbdd1-201ENSMUST00000027322 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Zc3h10-201ENSMUST00000040572 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm10629-201ENSMUST00000137706 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr452-202ENSMUST00000214465 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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