Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccser1Q8C0C4 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccser1Q8C0C4 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.9 ms