Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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NischQ80TM9 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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NischQ80TM9 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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NischQ80TM9 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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NischQ80TM9 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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NischQ80TM9 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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NischQ80TM9 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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NischQ80TM9 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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NischQ80TM9 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NischQ80TM9 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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