Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Actn1Q7TPR4 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms