Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms