Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Pkp1P97350 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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