Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp29Q9ES63 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms