Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Nhlrc3Q8CCH2 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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