Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Atg16l1Q8C0J2 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg16l1Q8C0J2 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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