Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms