Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx27Q3UHD6 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Snx27Q3UHD6 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Snx27Q3UHD6 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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