Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Traf3ip1Q149C2 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Traf3ip1Q149C2 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms