Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hoxd13P70217 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hoxd13P70217 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hoxd13P70217 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms