Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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Col5a3Q9JLI2 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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