Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Dsg1bQ7TSF1 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms