Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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