Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Rps6ka1-206ENSMUST00000168974 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpusd2Q149F1 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms