Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Col19a1Q0VF58 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms