Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Ccl20O89093 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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