Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Top3bQ9Z321 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top3bQ9Z321 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms