Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Hdac5Q9Z2V6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hdac5Q9Z2V6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac5Q9Z2V6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms