Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shcbp1Q9Z179 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shcbp1Q9Z179 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms