Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stub1Q9WUD1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms