Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lemd3Q9WU40 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms