Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp18Q9WTV6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp18Q9WTV6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms