Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TapbpQ9R233 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms