Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms