Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcf1Q9QZM3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcf1Q9QZM3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms