Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms